В продолжении «Бэтмена-ниндзя» семья Бэтмена возвращается в настоящее и обнаруживает, что Япония исчезла. Вместо нее над Готэм-сити парит остров Хиномото. Во главе острова стоит сверхмощная якудза, которая правит без человечности и напоминает Лигу справедливости. Теперь Бэтмену и его союзникам предстоит спасти Готэм!
